摩托车发动机进水会导致发动机熄火，再次启动会对发动机造成严重损坏。发动机可以压缩气体，但不能压缩水。如果发动机进水，不要再次启动，否则会严重损坏发动机。摩托车发动机的工作原理与汽车发动机相同，摩托车也采用四冲程汽油发动机。四冲程发动机工作时有四个冲程，分别是吸气冲程、压缩冲程、做功冲程和排气冲程。当发动机处于进气冲程时，进气门将打开，活塞将向下运行以吸入可燃混合物。当发动机处于压缩冲程时，进气门和排气门将关闭，活塞将向上运行以压缩可燃混合物。当发动机处于做功冲程时，进气门和排气门将关闭，火花塞将点燃可燃混合气。燃烧的可燃混合气会把活塞向下推，这样发动机才能输出动力。当发动机处于排气冲程时，发动机的排气阀将打开。这时活塞会向上运行，这样气缸内的废气就可以排出去了。四冲程发动机可以在运行过程中连续循环这四个冲程。一些摩托车使用二冲程发动机。二冲程发动机工作时只有两个冲程。这台发动机的速度相对较高。